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膜生物反应器内生化反应过程的格子Boltzmann模拟

杨艳霞, 李静

计算物理 2018, 35 (5): 571-576. DOI: 10.19596/j.cnki.1001-246x.7732

摘要（480）

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PDF （4894KB）（1239）

采用介观尺度的格子Boltzmann数值算法研究平板式膜生物反应器内生物膜结构对生化反应及流动传输的影响.利用四参数随机生成法重构不同多孔结构的生物膜，计算中耦合多块模型获得局部详细信息且提高计算效率.结果表明：生物膜结构稳定条件下，孔隙率增大有利于主流区与生物膜内的物质传输，可以提高底物降解效率；孔隙率一定条件下，改变生物膜的孔隙结构分布可以加强传质，强化生化反应过程，提高底物降解效率.

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强外电场作用下CCl₃F物理特性与光谱

程启源, 刘玉柱, 李静, 张巍, 陈飞, 林华, 秦朝朝

计算物理 2017, 34 (4): 489-494.

摘要（525）

HTML （0）

PDF （1305KB）（1235）

运用密度泛函理论在6-311++G（d，p）基组上进行优化并在x轴方向增加电场（F=-0.025~0.025 a.u.），对CCl₃F分子结构、偶极矩、总能量、电荷分布和能隙、C-Cl键特征吸收峰进行研究.结果表明：随着外场强度的增加，C-Cl键键长逐渐减小，偶极矩先减小后增大，总能量先增大后减小，Cl原子的电荷分布逐渐增大，当F=-0.015 a.u.时，由负电性转变为正电性，达到新的亲核亲电反应作用点.而能隙在没有外加电场时也达到最小值，此时最容易发生电场降解反应.C-Cl键的红外特征吸收峰随着负电场的增强出现蓝移.

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Particle-Mesh Ewald(PME)算法的GPU加速

徐骥, 葛蔚, 任瑛, 李静海

计算物理 2010, 27 (4): 548-554.

摘要（424）

PDF （372KB）（1246）

讨论在NVIDIACUDA开发环境下,用GPU加速分子动力学模拟中静电作用的长程受力计算部分.采用Particle-Mesh Ewald(PME)方法,将其分解为参数确定、点电荷网格离散、离散网格的傅立叶变换、静电热能求解与静电力求解5个部分,并分别分析各部分的GPU实现.此方法已成功用于7个不同大小的生物分子体系的模拟计算,达到了7倍左右的加速.该程序可耦合到现有分子动力学模拟软件中,或作为进一步开发的GPU分子动力学程序的一部分,显著加速传统分子动力学程序.

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