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肌红蛋白力致去折叠的全原子分析
和二斌, 罗志荣, 朱留华
计算物理 2020, 37 (
2
): 205-211. DOI:
10.19596/j.cnki.1001-246x.8009
摘要
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348
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可视化
位于脊椎动物骨骼肌中的肌红蛋白在生命过程中扮演着重要角色,其折叠过程依赖于血红素的绑定.本文着重于肌红蛋白在力的作用下去折叠过程的全原子统计分析.结果表明血红素不仅具有生物学上的功能,而且决定其去折叠的动力学过程.在血红素不存在的情况下,肌红蛋白的力致去折叠过程存在一个中间态,其构象不同于化学变性剂所导致的去折叠中间态,发现新的中间态.结论与相关实验结果相符,揭示了肌红蛋白力致去折叠的一般机制.
参考文献
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相场法模拟第二相颗粒对柱状晶形成的影响
罗志荣, 高英俊, 毛鸿, 卢成健, 黄世叶
计算物理 2016, 33 (
3
): 367-373.
摘要
(
421
)
HTML
(
5
)
PDF
(2450KB)(
1214
)
可视化
基于定向退火条件下的移动热区模型,采用相场法研究第二相颗粒对多晶材料中柱状晶结构形成的影响.结果表明:第二相颗粒对柱状晶结构的形成具有抑制作用,其抑制作用随第二相颗粒体积分数的增加和第二相颗粒尺寸的减小而增强.定向退火条件下第二相颗粒对晶粒极限尺寸的影响遵循Zener关系.为了获得良好的柱状晶结构,应尽量减少材料中第二相颗粒的体积分数及其在晶界上的弥散分布.
参考文献
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韧性材料的微裂纹扩展与分叉的晶体相场模拟
高英俊, 罗志荣, 邓芊芊, 黄礼琳, 林葵
计算物理 2014, 31 (
4
): 471-478.
摘要
(
612
)
PDF
(2210KB)(
1794
)
可视化
采用晶体相场方法研究韧性单晶材料在双轴拉伸条件下微裂纹扩展与分叉的演化过程,分析应变、温度、初始裂口形状等因素对裂纹扩展和分叉的影响.结果表明:对于简单的单向拉伸,应变需要达到一定的临界值,裂纹扩展才会启动.对于二组相互垂直的双轴拉伸作用,当应变达到临界值后,裂纹扩展过程中会发生分叉现象.温度越高,裂纹扩展越快且分叉越多.裂纹在扩展过程中,体系能量不断降低,当裂纹出现分叉时,体系能量降低得更快.在裂纹扩展过程中,有时是会在裂尖处前方出现微小的空洞,类似在裂纹尖端前方出现位错发射情况,这些微小的空洞逐渐扩大连成裂纹.本文所得结果与相关模拟结果和实验结果符合.
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晶体相场方法模拟纳米孪晶结构
高英俊, 王江帆, 罗志荣, 卢强华, 刘瑶
计算物理 2013, 30 (
4
): 577-581.
摘要
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324
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(1229KB)(
2185
)
可视化
应用双模晶体相场模型,模拟共格纳米孪晶结构.结果表明:球状晶粒生长成的共格孪晶片层,在共格面上的原子排列有变形,容易出现位错;条状晶粒凝固生长成的共格孪晶界,比用球状晶粒长大生成的共格孪晶界的原子排列整齐.应用晶体相场模型,可以精确计算纳米孪晶带的厚度,设计和控制带内的原子层数,实现人工操纵纳米共格孪晶片层结构,指导实验研究纳米孪晶结构及其与性能的关系.
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