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微喷射粒子团簇探测算法及其应用
张颖, 陈其峰, 曹小林, 蔡灵仓, 陈栋泉, 卢铁城
计算物理    2006, 23 (4): 441-446.  
摘要190)      PDF (396KB)(1023)   
在团簇多重标号技术基础上,提出了团簇探测的新算法,并以此作为大尺度二维和三维分子动力学模拟冲击加载金属材料微喷射粒子团簇分析的子程序.以二维为例描述了算法的逻辑结构,测试分析了算法的运行效率,并将其应用到二维分子动力学模拟冲击加载金属Cu和Al微喷射粒子的团簇统计分析中,对微喷射粒子团簇尺寸分布得到一些规律性认识.
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基于“块-单元”数据结构的分子动力学并行计算
曹小林, 莫则尧, 张景琳, 陈其峰
计算物理    2004, 21 (5): 377-385.  
摘要274)      PDF (581KB)(1292)   
开发了一种基于"块-单元"数据结构的可扩展并行算法,以实现大规模、非均匀分子动力学模拟.它采用空间填充曲线将三维区域分解转换为一维负载平衡问题,然后用基于实测的多层均权法求解,以保持处理机间负载均衡.在一个MPP并行机的500个CPU上,模拟包含2.1×108个粒子的三维金属微喷射模型,该算法获得了420倍的加速比.
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