激子-激子相互作用蛋白质能量传输模型的数值模拟研究

计算物理 ›› 1999, Vol. 16 ›› Issue (2): 145-150.

激子-激子相互作用蛋白质能量传输模型的数值模拟研究

黄延昭¹, 张文², 肖奕¹

1. 华中理工大学物理系, 武汉 430074;
2. 中科院生物化学研究所生物信息与蛋白质设计实验室, 上海 200031

收稿日期:1997-11-03 修回日期:1998-10-07 出版日期:1999-03-25 发布日期:1999-03-25
作者简介:黄延昭,男,27,助教,博士

Numerical studies on the model of the energy transport in protein induced by exciton exciton interaction

Huang Yanzhao¹, Zhang Wen², Xiao Yi¹

1. Department of Physics, HuaZhong University of Science and Technology, Wuhan 430074;
2. Lab of Bioinformatics & Protein Design, Shanghai Institute of Biochemistry, Shanghai 200031

Received:1997-11-03 Revised:1998-10-07 Online:1999-03-25 Published:1999-03-25

摘要/Abstract

摘要： 引入了一个新的模型来描述蛋白质分子中Amide-Ⅰ振动能量的贮存与传输。这种模型是在Davydov模型的基础上加以改进,引入激子的相互作用项。并用数值模拟的方法说明了该模型可以存在静止和运动的局域模式。

关键词: 孤子, 激子, 蛋白质分子, 离散非线性方程

Abstract: A model is proposed to study numerically the dynamics for the energy transportion of amide Ⅰ vibrations in proteins.The results show that there exists static and moving localized models in the mode and thus it may provides alternative mechanism of the energy transport in protein molecules.

Key words: soliton, exciton, protein molecule, discrete nonlinear function

中图分类号:

黄延昭, 张文, 肖奕. 激子-激子相互作用蛋白质能量传输模型的数值模拟研究[J]. 计算物理, 1999, 16(2): 145-150.

Huang Yanzhao, Zhang Wen, Xiao Yi. Numerical studies on the model of the energy transport in protein induced by exciton exciton interaction[J]. CHINESE JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS, 1999, 16(2): 145-150.

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